大豆分离蛋白的提取过程是很复杂的。

第一步是利用大豆蛋白的溶解特性，采用食品添加剂氢氧化钙碱溶液浸泡低温脱脂豆粕，使可溶性蛋白质、碳水化合物等溶解后，离去除杂质及皮等，清理后的豆粕送入溶解罐中，加入10-15倍水进行溶解，溶解温粉状大豆度控制在15-80℃离心分离，溶解时间控制在120min，溶解完成后调整pH值为7-7.6。再进行浆渣分离去除纤维素、低聚糖及矿物质等，

第二步将已溶解的蛋白溶解液进入酸沉析罐加入一定的酸，调pH至4.5达到大豆蛋白质的等电点，这时大部分蛋白质沉淀析出，只有极少数部分蛋白溶解，这溶解的部分叫做乳清，继续离心分离，获蛋白凝胶。乳清中的固形物亦可用超速离心机分离出来加以利用；

第三步是将获得的蛋白凝胶破碎进入碱液调节罐，加食品添加剂氢氧化钙碱中和，并经加热、均质等处理，送入喷雾干燥机中快速脱水干燥而获得成品。大豆分离蛋白作为食品添加剂的一种，其中用的辅料碱必须为食品添加剂氢氧化钙。